个人资料
教育经历2018年9月-2022年12月 上海交通大学,生物学,博士 2004年9月-2007年6月 中国矿业大学(北京),生物化工,硕士 2000年9月-2004年6月 中南大学,生物工程,学士 工作经历2025年2月-至今 华东师范大学药学院,副研究员 2023年2月-2025年1月 上海交通大学,研究助理 2017年3月-2018年8月 上海比金生物科技有限公司,技术顾问 2013年7月-2017年2月 中国科学院生物物理研究所,助理研究员 个人简介杨旭,女,博士,副研究员,硕士生导师,长期致力于蛋白酶复合物结构生物学研究。近十年在《Nucleic Acids Research》《International Journal of Biological Macromolecules》等国际权威期刊发表SCI论文13篇,聚焦蛋白酶-底物动态互作机制,综合运用X射线晶体学与冷冻电镜技术解析酶催化功能及转录调控网络,为酶分子理性设计与智能药物开发提供关键理论依据。 社会兼职研究方向1. 靶点特异性先导化合物发现:聚焦肿瘤、代谢疾病等重大领域,构建“苗头化合物识别→结构-活性关系解析→候选药物优化”的全链条研发体系。融合结构生物学(如X射线晶体学、冷冻电镜)、计算化学(分子动力学模拟、AI辅助设计)与药理学(体外/体内活性评价),突破传统药物设计局限,推动高选择性、低毒性创新疗法的临床转化。 2. 新靶标化学干预及功能机制研究:基于结构生物学与生物信息学分析,挖掘疾病关键调控靶标,设计特异性化学探针干预靶标功能,结合生化实验(酶活抑制、蛋白互作分析)与细胞模型验证,阐明靶标参与的信号通路及病理机制,为原创药物靶点确认提供科学依据。 招生与培养生物技术与工程 专业学位硕导 药学 学术学位硕导 开授课程科研项目学术成果1. Yang, X., Wang, Y., Zheng, J. Structural insights into autoinhibition and activation of defense-associated sirtuin protein. Int. J. Biol. Macromol. 2024, 277: 134145. 2. Yang, X., Wang, Y., Liu, G., et al. Structural basis of Streptomyces transcription activation by zinc uptake regulator. Nucleic Acids Res. 2022, 50(14): 8363–76. 3. Feng, Y., Yang, X., Ji, H., et al. The Streptomyces viridochromogenes product template domain represents an evolutionary intermediate between dehydratase and aldol cyclase of type I polyketide synthases. Commun. Biol. 2022, 5(1): 508. (共同一作) 4. Liu, G., Yang, X., Yan, W., et al. Molecular basis of Streptomyces ECF σShbA factors transcribing principal σHrdB genes. Nucleic Acids Res. 2025, 53: gkaf339. 5. Yang, S., Guo, W., Yang, X., et al. Structural and functional insights into StnY, a ribbon-helix-helix (RHH) family transcription factor regulating antibiotic resistance. Int. J. Biol. Macromol. 2025, 309: 142874. 6. Wang, Y., Tian, Y., Yang, X., et al. Filamentation activates bacterial Avs5 antiviral protein. Nat. Commun. 2025, 16: 2408. 7. Wang, Y., Yang, X., Yu, F., et al. Structural and functional characterization of AfsR, an SARP family transcriptional activator of antibiotic biosynthesis. PLoS Biol. 2024, 22(3): e3002528. 8. Xiao, Z., Zha, J., Yang, X., et al. A three-level regulatory mechanism of the aldo-keto reductase subfamily AKR12D. Nat. Commun. 2024, 15: 2128. 9. Zhou, Z., Yang, X., Huang, T., et al. Bifunctional NadC homologue PyrZ catalyzes nicotinic acid formation in pyridomycin biosynthesis. ACS Chem. Biol. 2023, 18(1): 141–50. 10. Luo, Q., Yang, X., Yu, S., et al. Structural basis for lipopolysaccharide extraction by ABC transporter LptB2FG. Nat. Struct. Mol. Biol. 2017, 24(5): 469–74. 11. Han L, Zheng J., Wang Y., Yang X., Liu Y., Sun C., Cao B., Zhou H., Ni D., Lou J., Zhao Y., Huang Y. Structure of the BAM complex and its implications for biogenesis of outer-membrane proteins. Nat. Struct. Mol. Biol. 2016, 23(3): 192–6. 12. Yang X, Chang HR, Yin YW. Yeast Mitochondrial Transcription Factor Mtf1 Determines the Precision of Promoter-Directed Initiation of RNA Polymerase Rpo41. PLoS One. 2015, 10(9): e0136879. 13. Meyer AJ, Garry DJ, Hall B, Byrom MM, McDonald HG, Yang X, Yin YW, EllingtonAD.Transcriptionyieldoffully2-modifiedRNAcanbeincreasedbythe addition of thermostabilizing mutations to T7 RNA polymerase mutants. Nucleic Acids Res. 2015, 43(15): 7480-8. 14. NiD,WangY,YangX,et al. Structural and functional analysis of theβ-barrel domain of BamA from Escherichia coli. FASEB J. 2014, 28(6): 2677-85. 15. YinH,XiangS,ZhengJ,FanK,YuT,YangX,PengY,WangH,FengD,LuoY, BaiH,YangK.Inductionofholomycinproductionandcomplexmetabolicchanges by the argR mutation in Streptomyces clavuligerus NP1.Appl Environ Microbiol. 2012, 78(9): 3431-41. 16. Wilkins BJ, Yang X, Cropp TA. Photochemical control of FlAsH labeling of proteins. Bioorg Med Chem Lett. 2009, 19(15): 4296-8. 17. Xiang SH, Li J,Yin H, Zheng JT, Yang X, Wang HB, Luo JL, Bai H,Yang KQ. Application of a double-reporter-guided mutant selection method to improve clavulanic acid production in Streptomyces clavuligerus. Metab Eng. 2009, 11(4- 5): 310-8. 18. WangSL,FanKQ,YangX,et al.CabC,anEF-handcalcium- bindingprotein,isinvolvedinCa2+-mediatedregulationofsporegerminationand aerialhyphaformationinStreptomycescoelicolor.JBacteriol.2008,190(11):4061- 8. 荣誉及奖励 |